这是记忆脱离了人类，拥有了独立意识之后的世界，也是个魔法文明高度发达的世界，人类与记忆体生命的关系，维系于一种被称为记忆使的特殊人类。原本生活在地球的主角，以成为记忆使为目标，进入了位于土卫三上的特提斯学院，在一次搭乘记忆列车往返于土星与地球之间的过程中，无意中遇到了两个奇怪的少女。而那两个少女，居然是没有人见到过具体形态的记忆体生命……自此之后，在说不清是偶然与必然的命运里，人类、记忆体、纸片人、各种奇怪的、软或不软的萌妹子纷纷登场，进入了主角小小的世界…… 记忆体萌娘